学校于2000年5月27日由原武汉工业大学、武汉交通科技大学、武汉汽车工业大学合并组建。武汉工业大学起源于1948年的中国人民解放军东北军区军工部工业专门学校，历经调整、合并等演进和发展，1985年更名为武汉工业大学，1998年由原国家建筑材料工业局所属划转为教育部主管。武汉交通科技大学起源于1946年的国立海事职业学校，历经调整、合并等演进和发展，1993年更名为武汉交通科技大学，隶属原交通部。武汉汽车工业大学起源于1958年的武汉工学院，历经调整、合并等演进和发展，1995年更名为武汉汽车工业大学，隶属原中国汽车工业总公司。
截至2019年11月，学校有3个校区，占地近4000亩，总建筑面积178.28万平方米，图书馆藏书31091万册；在校普通本科生36000余人，博士、硕士生18000余人，留学生1700余人；教职工5477人，其中专任教师3243人；设有25个学院（部），91个本科专业；拥有博士后科研流动站17个，一级学科博士点19个，一级学科硕士点46个，硕士专业学位授权类别16个，硕士专业学位授权领域40个。
武汉理工大学艾克斯马赛学院是由武汉理工大学和法国艾克斯马赛大学合作创建,经教育部批准设立的非独立法人性质的中外合作办学机构，是湖北省唯一一家中法合作办学机构，也是湖北省首家同时涵盖本科及硕士研究生学历教育的中外合作办学机构。学院每年招收本科生240人，研究生80人，总规模1200人。
办学宗旨：集聚中外优质教育资源，培养国际一流人才，造就一流学术成果，创造更多社会价值。
办学层次：本科生学历教育、硕士研究生学历教育。
培养目标：按照“开放兼容、协同创新”的办学思路，集聚中法优质教育资源，培养熟悉中西方文化，具有国际视野、创新精神和卓越能力的高层次国际化人才，提升学生未来职业发展、参与国际竞争的能力。
培养模式：充分利用武汉理工大学和艾克斯马赛大学的教学条件和资源，制定双方认可的共同培养方案，实施中法双导师制联合培养模式，学生课程学习期间有不少于30%的专业课程由法方派出优秀师资来武汉理工大学授课。理论课程结束后，经中期考核合格后，学生可自由选择赴艾克斯马赛大学开展课题研究或继续留在武汉理工大学完成课题研究及后继培养计划。
招生专业：
本科：生物技术、制药工程
硕士：化学工程与技术、生物医学工程
学历学位：
本科：录取学生可同时注册拥有武汉理工大学和法国艾克斯马赛大学（简称AMU）两校学籍。本科生按照中法双方共同制定的教学计划修完所规定的全部课程，取得规定学分，可获得武汉理工大学本科毕业证证书；达到中法双方共同规定的学士学位授予条件，无论培养期间是否赴法方学习，均可同时获得中法双方学士学位证书。
硕士：硕士生按照双方共同制定的培养计划修完所规定的全部学分，达到双方学位授予要求，通过论文答辩，无论培养期间是否赴法方学习，可同时获得武汉理工大学硕士毕业证书和学位证书，以及艾克斯马赛大学相应的硕士学位证书。
培养特色：
1. 中法优势互补，开办新兴战略产业支撑专业服务国家战略需求
2. 中西方教育理念融合，重视学生的全面发展
3. 一本线上录取，确保生源质量，学风严谨
4. 学在武汉理工大学，可注册为AMU学生，毕业可获双学位
5. 中法共同制定人才培养方案，双方教学内容无缝对接
6. 中法共建高水平教学团队，确保卓越人才培养质量
7. 中法共建高水平生物学-医学科研平台，支撑创新人才创新能力培养
8. 搭建跨文化交流平台，突出特色素质教育，全面提升综合素质
9. 完善的奖学金体系，支持学生双向无障碍交流学习
